Die Hochschule Macromedia wird auf der Basis einer verbindlichen Grundordnung geleitet, deren Prinzip die enge Zusammenarbeit zwischen Vertreter /innen aus der Lehre und der Verwaltung auf allen Ebenen ist. Das oberste Gremium ist das Präsidium. Dort werden alle strategischen Entscheidungen gemeinsam im Austausch des Hochschulpräsidenten mit dem Vizepräsidenten Hochschulmanagement und der Vizepräsidentin Lehre und Professurenentwicklung getroffen.
Der Präsident repräsentiert die Hochschule nach außen. Intern sorgt er für das Zusammenwirken der Organe. Er ist verantwortlich für alle akademischen Grundsatz- und Forschungsangelegenheiten, insbesondere für die akademische Grundsatzprogrammatik, die Neu- und Weiterentwicklung von Forschungs- und Studienprogrammen und deren Qualitätssicherung in akademischen Angelegenheiten.
Der Vizepräsident für Lehre und Professurenentwicklung ist verantwortlich für alle grundsätzlichen die Lehre und das Lernen betreffenden Angelegenheiten, die Qualitätssicherung der akademischen Personalgewinnung sowie die Gestaltung struktureller Rahmenbedingungen zur akademischen Personalentwicklung.
Die Vizepräsidentin Hochschulmanagement nimmt die Geschäftsführung der Hochschule wahr. Sie leitet die zentrale Hochschulverwaltung (IT, Personal, Finanzen, Marketing und Vertrieb) und ist für den ordnungsgemäßen Haushaltsvollzug verantwortlich.